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本发明涉及一种茄果类蔬菜专用的混合菌株微生物肥料及其制备方法。属于农业微生物技术领域。其特征在于:按照重量份数计,原料组分包括木炭粉30~35%,草炭25~30%,食用菌渣:6~10%,腐殖酸6~10%,黄腐酸钾1~3%,稀土1~3%,蕈状芽孢杆菌Bacillus mycoides Gnyt1菌株发酵液10%,枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis FX2菌株发酵液10%。该混合菌株微生物肥料,具有固定空气中氮素,溶解土壤中难溶性磷的作用,可以提供给茄果类蔬菜全面、均衡、易吸收的养分,另一方面,微生物肥料中的菌株具有分泌植物激素能力和拮抗病原菌的能力,可以调节茄果类蔬菜的生长,预防病害发生。