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本发明属于纳米材料制备技术和纳米生物应用领域,涉及一种磁性上转换纳米复合材料的制备方法,以DNA分子为桥梁,利用碱基互补配对作用将磁性纳米粒子和稀土掺杂上转换纳米粒子连接起来,构建磁性上转换纳米复合结构,该结构兼具超顺磁性和上转换发光特性;通过调节体系pH值、升温或加入竞争DNA,移除磁性纳米粒子,可消除磁性组分对上转换发光的淬灭,提高基于上转换发光特性的检测灵敏度。本发明方法简单,操作便捷,合成的磁性上转换纳米复合材料可应用于生物分离、生物检测、上转换荧光成像等生物医学领域。