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本发明提供了一种亚心形扁藻培养基配方,该培养基配方如下:氮盐80-120mg/L,KH2PO410mg/L,柠檬酸铁5mg/L,Na2EDTA 10-12mg/L,稀土盐0.5-1mg/L,生长调节剂0.01-0.1mg/L,VB10.006mg/L,VB120.05mg/L,ZnSO4·4H2O 23μg/L,MnCl2·4H2O 178μg/L,CuSO4·5H2O 10μg/L,Na2MoO4·2H2O 7.3μg/L,CoCl2·6H2O 12μg/L。本发明所述的培养基在培养扁藻时具有生长速率快、细胞密度大等特点。