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本发明涉及一种氨基酸修饰的水溶性的稀土上转换发光纳米粒子的制备方法,该方法以高发光强度的油酸修饰的NaYF4:Yb/Er上转换纳米粒子为基础,在pH3-5的酸性环境中,用溶剂萃取的方法将NaYF4:Yb/Er上转换纳米粒子表面的油酸除去,再用氨基酸对去除了油酸的稀土上转换纳米粒子进行功能化,得到水溶性的稀土上转换发光纳米粒子。本发明制备的稀土上转换纳米粒子不仅继承了油酸修饰的NaYF4:Yb/Er上转换纳米粒子的高发光强度,而且完全水溶性,表面带有可供交联生物分子的氨基和羧基官能团。本制备方法简便,容易操作,具有良好的应用前景。