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本发明公开了一种用于水体均衡系统上的生物修复营养剂及其制备方法，生物修复营养剂由藻类组分、水剂微生物组分以及营养颗粒和粉剂组分而组成；藻类组分包括小球藻和添加到小球藻上的植物细胞分裂素；水剂微生物组分包括光合细菌、酵母菌、乳酸菌、复合芽孢杆菌、粪链球菌、丁酸梭菌、蛭狐菌和酵素；营养颗粒和粉剂组分包括五氧化二磷、稀土、硅土、有机发酵物和增效剂。在制备方法上，分为藻类组分的制备、水剂微生物组分的制备以及营养颗粒和粉剂组分的制备。本发明采用阴阳平衡法则的原理，利用有益单胞藻和有益微生物的作用，有效地分解腐烂的水草，起到氮磷平衡的转化功能，增加水体的溶解氧，提高水产品的代谢免疫功能，大大降低养殖成本，造就一个生态循环的水环境。