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本发明属于纳米探针技术领域,公开了一种复合纳米探针及其用于活体比率成像检测的方法。该种复合纳米探针包含近红外有机荧光染料和近红外无机稀土纳米材料,其中,近红外有机荧光染料包含花菁类、罗丹明类或BODIPY类探针分子,近红外无机稀土纳米材料包含核结构或核‑壳结构的稀土氟化物。在近红外光的激发下,有机荧光染料与稀土纳米材料都可以发射出近红外光,且互不干扰。当与特定物种相互作用后,有机荧光染料的发射峰位置或强度的大小会发生变化,而稀土纳米材料的发射峰不受影响,从而导致两个近红外发射峰的比率随特定物种的加入而发生规律性变化,以该比率变化为检测信号即可实现对特定物种的检测及成像功能。