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本发明公开了一种用于调节肠道菌群及增强免疫力的乳酸菌组合物,包括乳酸菌组合核,所述乳酸菌组合核外包裹有包被层;所述包被层包括重量份数的成份:低聚异麦芽糖30~50、蛋白物质30~50、硝酸纤维素5~10、有机酸根稀土盐0.5~1;所述乳酸菌组合核由如下重量份数的菌株组成:乳双歧杆菌30~40、罗伊氏乳杆菌20~30、鼠李糖乳杆菌10~20、婴儿双歧杆菌10~20。本发明还公开了其制备方法。本发明具有能增加肠道内有益菌的比例并能增强人体免疫力的优点。